Nel 1959, il Sig. Hubbard si trasferì a Saint Hill Manor, ad East Grinstead, nel Sussex per continuare la ricerca, insegnamento e le conferenze sulla spiritualità. Tra gli sviluppi significativi dei primi anni sessanta ci fu linaugurazione delle conferenze del Corso di istruzione speciale di Saint Hill, oltre al delineamento del Ponte verso la libertà totale di Scientology e degli incrementi graduali del Ponte in direzione di gradi crescenti di progresso spirituale.
Per potersi dedicare alla ricerca sul raggiungimento dei gradi massimi della spiritualità di Scientology, il Sig. Hubbard diede le dimissioni dalla carica di Direttore Esecutivo della rete mondiale delle chiese di Scientology e nel 1967, si spostò in alto mare per concentrarsi sulla ricerca in un ambiente privo di distrazioni.
A bordo della nave Apollo, un natante di 3.200 tonnellate, egli si dedicò a semplificare i gradi inferiori di Scientology e proseguì la ricerca verso il conseguimento dei massimi gradi spirituali. Egli iniziò inoltre a ricercare soluzioni per i problemi principali della società. Nel 1969, dopo aver osservato le conseguenze in termini di declino spirituale e culturale delluso di stupefacenti, egli iniziò ad elaborare quello che sarebbe poi divenuto noto come il Programma Hubbard per il recupero dei tossicodipendenti. Allo stesso modo, avendo notato il livello mondiale di analfabetismo e di spreco sociale risultanti da un sistema scolastico carente, Hubbard iniziò a sviluppare delle metodologie di studio per uso secolare. Le scoperte in queste aree vennero a costituire la genesi di svariati programmi di miglioramento delle comunità che sono poi diventati un impegno a livello mondiale della Chiesa.